Op de officiële Japanse website van Dragon Quest XI: In Search of Departed Time werden meer details gegeven over de 3DS-versie van de rpg. Het is bijvoorbeeld mogelijk om te wisselen tussen 2D- of 3D-graphics. De twee modi worden aan het begin van de game zelfs tegelijk op de twee schermen van de handheld getoond.
Wanneer je eenmaal hebt gekozen tussen één van de stijlen, kun je altijd weer naar de andere stijl gaan via kerken in de game. De gevechten zijn ook anders afhankelijk van of je in 3D of 2D speelt. De 3DS-versie van de game krijgt overigens ook een extra stadje die volledig gebruikmaakt van de StreetPass-opties van de handheld.