Er is tijdens de Splatoon 2-Direct ook meer informatie gegeven over hoe amiibo werken in de game. Door eem Splatoon amiibo te gebruiken kunnen spelers onder andere hun settings voor de controller, alsmede hun gear en andere materialen bewaren op de amiibo.
Zowel de nieuwe Splatoon-amiibo als de eerder verschenen Splatoon-amiibo werken in de game en geven ook exclusieve gear wanneer ze in de game worden gebruikt.